La Facultad de Ciencias Económicas posee un tipo de organización departamental y de institutos que aseguran el cumplimiento de los objetivos en materia docente y de investigación respectivamente. Entre los departamentos e institutos existe una recíproca relación funcional, integrando ambas áreas específicas de acuerdo a sus respectivas incumbencias. Su misión es analizar, evaluar y coordinar todas las actividades docentes, pedagógicas y administrativas implicadas en el accionar de su área específica.